Предприятия пищевой промышленности, оборудование и инструменты должны постоянно находиться в чистоте. Это условие направлено на то, что уменьшается вероятность попадания вредных микроорганизмов в продукты. Чтобы требования САН ПИНА были соблюдены, следует проводить дезинфекцию помещений, оборудования. Работа с продуктами требует чистоты всего помещения, риск отравления некачественными продуктами в этом случае будет сведён к нулю. Каждое предприятие должно иметь специальное оборудование для мойки и дезинфекции помещения и инструментов, дезинфекция должна проводиться каждый день, после окончания рабочей смены.

Предприятия по изготовлению консервов работают с продуктами, которые сильно загрязняют рабочую поверхность, поэтому нужна тщательная уборка, и конечно дезинфекция. Применяемые средства должны обладать антимикробными свойствами, рабочая поверхность, обработанная дезинфицирующими средствами, должна быть максимально очищена от любых минеральных и органических загрязнений. Используемые препараты не должны быть токсичными и вызывать аллергию. Все применяемые средства должны легко смываться, чтобы после обработки не соприкасались с продуктами. Для облегчения трудоёмкого процесса дезинфекции используют автомат для мойки и дезинфекции.

С помощью автомата дезинфекция проводится пеной, она очищает всё оборудование после каждой смены работы. Обработка помещения инвентаря и оборудования обеспечивает снижение наличия болезнетворных бактерий, удаление разного вида загрязнений на оборудовании, что позволяет организовать работу в соответствии с нормами САН ПИНА. Персонал предприятия тоже должен соблюдать требования гигиены, которые к ним предъявляют. На предприятиях молочной промышленности следует проводить мойку и дезинфекцию автотранспорта.

Молоко такой продукт, который быстро может испортиться, поэтому даже транспорт должен систематически проходить дезинфекцию. Руководство предприятия, по изготовлению молочных продуктов, обязательно должно организовать мойку и дезинфекцию молочного оборудования, чистота его сокращает возможность кишечных отравлений. Применяется не только наружная мойка и дезинфекция, но и внутренняя, ей подвергаются дозаторы, фасовочные аппараты, варочные котлы пастеризаторы. Система вентиляции, тоже должна быть промыта и дезинфицирована. Подсобные помещения, а также душевые комнаты персонала, должны подвергаться дезинфекции.