Штрафы санэпидемстанции, согласно Кодексу РСФСР могут быть наложены только после проведения экспертизы и заключения врача или лицом, которое временно исполняет его обязанности. Протокол о нарушении рассматривается в течение двух недель со дня его подачи. Постановление, которое выносит врач, подлежит обжалованию в течение десяти суток. Для подачи обжалования постановления, необходимо обращаться в суды города, района, или в вышестоящие инстанции.

Согласно Административному кодексу, наложенные штрафы санэпидемстанции должны быть предъявлены исполнителю не позднее трех месяцев, если же этот срок будет упущен, исполнитель имеет полное право не оплачивать выписанный штраф. В случае подачи обжалования постановления, которое не было удовлетворено судом в пользу исполнителя, суд назначает сроки выплаты денежных взысканий. Если после вынесения постановления о наложении штрафа, исполнитель не подавал прошение об обжаловании, он обязан в течение двух недель заплатить всю сумму штрафа. Административный Кодекс допускает отсрочку платежа по штрафу не более, чем на один месяц.

Штрафы санэпидемстанции обязательны к уплате. Недобросовестным исполнителям не стоит надеяться на то, что от уплаты денежного взыскания можно уйти. Органы контроля, в ведомстве которых находится санэпидемстанция, имеют достаточно большой потенциал, чтобы воздействовать на нарушителей закона. В случае неуплаты штрафа в отведенные сроки, начинает начисляться пеня, размером в один процент от всей суммы штрафа за каждые сутки просроченной платы. Решение о начислении штрафной пени выносит суд.

Согласно статьям Административного Кодекса, о безопасности пищевой продукции, штраф может быть наложен в размере 10 - 40 прожиточных минимумов. В случае невыполнения предписаний санэпидемстанции, которые выносятся контрольными антимонопольными органами, органами метрологии и сертификации пищевой продукции, на недобросовестного исполнителя может быть наложен денежный штраф в размере до 5 тысяч прожиточных минимумов.

Если исполнитель не согласен с вынесенным решением, он имеет право обратиться в судебные инстанции для признания решения неправомерным, или для уменьшения суммы денежного взыскания. Обратиться в суд за обжалованием решения можно в течение шести месяцев после его вынесения. Оперативное обращение в судебную инстанцию может значительно повлиять на итоговое решение суда.