Заключительная дезинфекция проводится в тех местах, где были обнаружены очаги инфекций, для возбудителей которых характерна устойчивость к окружающей среде. Таких инфекций существует огромное количество - это чума, тиф, холера, риккетсиозы, дизентерия, лихорадка, сальмонеллезы, сибирская язва, кишечные инфекции, гепатиты, полиомиелит, колиты и гастроэнтериты, туберкулез, дифтерия, грибки, чесотка, лепра, энтеровирусные инфекции, глистные инвазии и многие другие.

Целью заключительного этапа дезинфекции является полное обеззараживание всех объектов, находящихся в очаге инфицирования. Это связано с тем, что на них мог попасть возбудитель конкретного заболевания, и они могут служить разносчиками инфекции. Именно заключительный этап обработки, выполненный правильно и вовремя, а также в конкретной последовательности невероятно важный. При этом он будет более эффективен, если удаление очага тифа либо других карантинных инфекций будет происходить одновременно с эвакуацией заболевшего.

Заключительную дезинфекцию проводят два три человека. На территориях городов и районных центров в состав бригады входят врач-дезинфекционист или помощник эпидемиолога или инструктор дезинфектора, а также один либо два дезинфектора. В селах заключительный этап дезинфекции проводит под руководством фельдшера или заведующего врачебным заведением, дезинфектор сельского участка. У этих работников должны быть гидропульт, ведра имеющие отметки на пять и десять литров, щетки, предназначенные для чистки мягких предметов, распылители для порошкообразных и жидких субстанций, мешки, тюфячные наволочки, при помощи которых можно будет осуществлять транспортировку вещей. Более того, важными атрибутами являются дезинфекционная камера, тара для препаратов, частая обеззараженная ветошь, полиэтиленовые мешки, предназначенные для чистой и уже использованной ветоши и спецодежды, специальные препараты и мыло. Сотрудники должны быть в халатах, колпаках либо косынках-респираторах, защитных очках, резиновых перчатках.

Следует учесть, что заключительная дезинфекция в очагах туберкулеза и других опасных заболеваний выполняется персоналом, который оснащен специальной защитной одеждой, предусмотренной инструкцией. Например, в очагах тифа дезинфекторы должны быть одеты в специальные комбинезоны. Когда бригада дезинфекционистов прибывает в очаг заражения, ее руководитель предупреждает всех жителей о предстоящем мероприятии. Также он определяет, то место, в котором будет храниться верхняя одежда участников, переодевается в защитный костюм и начинает обследовать местность и выяснять обстоятельства. Это поможет составить план и подобрать способ проведения заключительной дезинфекции.

Во время проведения текущих и заключительных дезинфекций обработке подвергаются все предметы, которые были использованы зараженным человеком либо животным, а также те, которые находились в очаге инфекции. По той причине, что не всегда имеется возможность установить, где находится обсеменение патогенными организмами рекомендовано расширять масштабы дезинфекции. В том случае, если возникли подозрения на другие инфекции, проводятся те же мероприятия.